我科研团队揭示单细胞分辨率下出生后猪肝脏的动态发育
科技日报记者 魏依晨 近日,科研江西农业大学猪遗传改良与种质创新全国重点实验室黄路生院士团队在《科学通报》在线发表了重要研究成果。团队该成果构建了迄今最全面的揭示出生后猪肝脏单细胞发育图谱,表征了肝脏细胞类型在四个不同发育阶段的单细动态异质性,鉴定了主要细胞类型特异的胞分辨率转录因子并揭示了其发育过程中基因表达的动态变化。 据了解,下出该研究以断奶前(30天)、生后断奶后(42天)、猪肝脏生长高峰(150天)和成年阶段(730天)四个生长发育重要阶段、发育不同性别、科研健康巴马香猪肝脏作为研究材料,团队综合使用scRNA-seq、揭示snRNA-seq和snATAC-seq技术,单细动态深入研究了猪肝脏不同发育阶段代谢和免疫功能的胞分辨率动态变化。 记者获悉,下出此次研究的主要创新包括:绘制了迄今为止所有哺乳动物中最新最全面的出生后肝脏单细胞发育图谱,鉴定并验证了稀有细胞类型;发现了肝实质细胞呈现高度的发育阶段异质性,揭示了与肝实质细胞发育或功能相关的阶段特异的转录因子编码基因;首次鉴定到LUZP2是成年猪肝窦内皮细胞特异的转录因子编码基因,提示其发挥阶段特异性功能;揭示了肝窦内皮细胞发育阶段特异性的功能变化,尤其是清道夫功能;发现了淋巴系免疫细胞(NK和T)出生后30天即主导肝脏免疫系统,其中肝脏组织驻留NK细胞(trNKs)表现出了与人类相似更保守的转录因子表达模式。 据了解,对健康家猪、雌性以及雄性个体不同发育阶段肝脏单细胞及单核转录组的系统研究,不仅对于提高家猪生产效率及饲料利用效率具有重要意义,同时,也为人类健康肝脏不同发育阶段的单细胞组成与功能提供了重要参考。 (江西农大供图)
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